18.05.2016

Целевое секвенирование панели генов для фокальной эпилепсии

M.S. Hildebrand, C.T. Myers, G.L. Carvill et al.

Цель: авторы сообщают о целевом секвенировании (определение аминокислотной/нуклеотидной последовательности) панели генов фокальной эпилепсии, наиболее распространенной фенотипической группе эпилепсии

Методы: панель была разработана с использованием молекулярно-инверсионной зондовой (МИЗ) технологии захвата и массово-параллельном секвенировании

Результаты: авторы продемонстрировали, что мутации могут быть обнаружены в 4 ранее генотипированных случаях фокальной эпилепсии. Авторы изучали как наследственную, так и соматическую мутацию у 251 пациента сл спорадической и фамильной фокальной эпилепсией без этиологического фактора и обнаружили 11 новых или очень редких миссенс-вариантов в 5 различных генах: CHRNA4, GRIN2B, KCNT1, PCDH19 и  SCN1A. Из них 2 были патогенными или вероятно патогенными предикторами, объясняющими ∼0,8% причин эпилепсии в когорте, а 8 имели неопределенные значения на основе имеющихся данных.

Выводы: авторами была разработана и ратифицирована целевая панель генов для фокальной эпилепсии – наиболее важного клинического вида эпилепсии, составляющего 60% всех случаев. Применение технологии МИЗ является инновационным подходом, который будет выгодно использовать для скрининга больших групп пациентов в клинических условиях из-за высокой чувствительности, эффективности и низкой стоимости. Результаты исследования демонстрируют, что мутации в известных генах, вероятно, объясняют появление только небольшой части случаев фокальной эпилепсии. И это не удивительно, учитывая установленную клиническую и генетическую гетерогенность этого заболевания, что подчеркивает необходимость дальнейшего исследования генов для этого сложного заболевания.

Neurology. Published online, апрель 2016